教員プロフィール:吉留 崇 助教

 

教員プロフィール

◎大学院工学研究科 応用物理学専攻
YOSHIDOME, Takashi
◎研究キーワード
タンパク質 水和 溶液理論 深層学習 リガンド結合
◎研究内容
創薬への応用を目指し、既存のリガンド結合予測(タンパク質に特異的に結合し、その機能を制御する小分子の結合位置を予測すること)では無視されていた「水和」を顕に考慮することで、リガンド結合予測精度を向上させることを目指している。そのためには、タンパク質周りの水の分布(水和分布)を短時間に計算する必要があるが、最近、水和分布が既存の手法の約1000分の1の計算時間(約10秒)で得ることが出来る手法を開発した(投稿準備中)。この手法を武器として、高精度なリガンド結合予測法の確立を目指している。
◎産学連携の可能性
現在、製薬会社との連携を打ち合わせ中。
◎代表的研究成果
T. Yoshidome, M. Ikeguchi, and M. Ohta, J. Comput. Chem., 41 (2020), 2406-2419.
T. Yoshidome, T. Ekimoto, N. Matubayasi, Y. Harano, M. Kinoshita, and M. Ikeguchi, J. Chem. Phys., 142 (2015), 175101(1-12).
更新日:2021/10/30
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